Nucleariida thuộc là các opisthokont,[2] nhánh lớn này bao gồm động vật, nấm và các nhóm nhỏ hơn. Nhiều nghiên cứu đã xếp nucleariida là một nhóm chị/em với nấm.[3][4]

Một trong các quan điểm về các giới lớn và các nhóm thân cây của chúng.[5]

Nhóm này gồm các chi:

• Nuclearia[2] và Micronuclearia.
• Các chi khác: Rabdiophrys, Pinaciophora, và Pompholyxophrys, là những dạng sống trong môi trường nước ngọt với vỏ silic rỗng hoặc có gai. Các chi nhày trước đây nằm trong heliozoa với tên gọi Rotosphaerida.

Theo một bài báo năm 2009, Fonticula là một opisthokont và có quan hệ gần với Nuclearia hơn là với nấm.[6]